일요주간 - 차 의과학대학교 박준호 교수팀, 세포 20개로 단백질 5600종 분석... ＂암 바이오마커 발굴의 새 지평＂

기존 장비의 분석 조건 최적화… 극미량 시료 분석의 접근성과 효율 높여
Her2 유방암 조직 내 단백질 차이 확인… 국제학술지 'Analytical Chemistry' 게재

▲ 차 의과학대학교 의학전문대학원 의과학교실 박준호 교수 연구팀. (사진=차병원 제공)

 

세포 수십 개에 해당하는 극미량 시료만으로 단백질 수천 종을 분석할 수 있는 기술이 개발됐다. 고가의 전용 장비를 추가로 도입하지 않고 기존 분석 장비의 측정 조건을 개선해 암 조직의 세부적인 생물학적 특성까지 파악했다는 점에서 임상 바이오마커 발굴 등에 활용될 것으로 기대된다.

차 의과학대학교 의학전문대학원 의과학교실 박준호 교수 연구팀은 박스카(BoxCar) 측정 방식과 내로우 윈도우 DIA(narrow-window DIA)를 결합한 새로운 단백체 분석법 'nbDIA'를 개발했다고 5일 밝혔다. 이번 연구는 서울대병원 병리과 유한석 교수팀, 메테오바이오텍과 공동으로 진행했으며, 연구 결과는 미국화학회(ACS)가 발행하는 국제학술지 '애널리티컬 케미스트리(Analytical Chemistry)'에 게재됐다. 

 

연구팀은 개발한 분석법으로 세포 약 20개 분량의 시료에서 단백질 5600여 종을 검출했으며, 반복 분석에서도 측정값의 편차가 작아 안정적인 성능을 확인했다. 이어 HER2 양성 유방암 환자의 조직을 세포 30~60개 규모의 미세 영역 20곳으로 나눠 분석해 단백질 6100여 종을 검출했다. 

 

동일한 종양 안에서도 HER2 단백질 발현량에 따라 단백질 구성이 달랐으며, 유전자 발현 분석에서는 확인되지 않았던 HER2 관련 신호전달 경로의 활성화도 단백질 분석을 통해 확인했다. 연구팀은 이번 기술이 암 조직 내 이질성 연구와 소수 세포 집단 분석, 임상 바이오마커 발굴 등에 활용될 수 있을 것으로 보고 있다. 

 

박준호 교수는 “개발된 기술로 극미량 시료의 단백체를 심도 있게 분석할 수 있음을 보였다”며 “암 조직 내 이질성 연구, 수가 적은 세포 집단 분석, 임상 바이오마커 발굴 등에 활용할 수 있을 것”이라고 말했다.

 

 

일요주간 / 하수은 기자 jlist@naver.com 

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